员工恶意毁坏公司的资料怎么处理

公司的资料是企业经营者的重要经营信息、商业秘密和无形资产，员工故意毁坏公司资料是破坏生产经营的行为，如果造成较重大损失或者其他严重后果，可以按破坏生产经营罪追究刑事责任。

《刑法》第二百七十六条规定，由于泄愤报复或者其他个人目的，毁坏机器设备、破坏生产经营的，处三年以下有期徒刑、拘役或者管制；情节严重的，处三年以上七年以下有期徒刑。