如何判斷分子離子峰

除同位素峰外（同位素天然丰度及丰度比可以參考Beynon表），某些重排反應也會產生M-1、M-2、M+1和M+2甚至更大質荷比的棒圖。大多數情況下確定分子離子峰是有一些規則可循的，有時還要結合一些特殊的、具體的情況來確定。構成分子離子峰有三個必要條件： 在質譜圖中一般是最高質量的離子；必須是一個奇電子離子；在高質量區，它能合理地丟失中性碎片而產生重要的碎片離子。